A identificação dos vírus em mosquitos coletados pela MosquiTRAP® é feito por meio das metodologias de RT-PCR. Os tubitos com mosquitos recebidos pela Ecovec são processados e parte do conteúdo deles é agrupado em lotes e sub lotes. Isso ocorre para facilitar as análises de biologia molecular. Os tubitos são agrupados, primeiramente, em lotes de até 20 mosquitos. Após a análise do lote, se o teste indicar positividade para os vírus, o grupo é subdivido em sub lotes ou em tubitos/armadilhas e analisado novamente, até o resultado final definitivo ser divulgado.